劇場版ラストカットの「シンカリオンはまだまだ止まらない！」から1年と3か月… その言葉通り、新たな主人公、新たな舞台、そして新たなシステム「Z合体」を引っ提げて、「シンカリオン」が帰ってきた！ オカルト好きの運転士と、シンカリオンに乗れない整備…